Implementasi Komputasi dalam Bidang Kimia
Komputasi Modern
Komputasi
merupakan salah satu cara untuk menemukan pemecahan masalah dari data input
dengan menggunakan suatu algoritma. Sebelum adanya komputer perhitungan
komputasi dilakukan dengan cara manual dengan alat bantu alat tulis kapur dan
batu, pensil dan buku, cara ini sesekali menguras pikiran dan mental. Namun
dengan adanya komputer, kini perhitungan komputasi menjadi sangat mudah. Komputer
termasuk kedalam komputasi modern karena, komputasi modern merupakan konsep
sistem yang menerima intruksi dan menyimpannya ke dalam memori, dalam hal
komputer memori yang dimaksud adalah memori komputer.
Secara
umum ilmu komputasi merupakan bidang ilmu yang memiliki perhatian pada
penyusunan model matematika dan teknik penyebaran numerik dan penggunaan
komputer untuk menganalisis dan memecahkan masalah dalam berbagian keilmuan.
Ilmu komputasi dalam penerapan praktis biasanya berupa penerapan similasi
komputer atau penyelesaikan masalah lain, dalam perkembangannya komputasi
digunakan untuk menemukan prinsip baru yang mendasar dalam bidang ilmu. Bidang ini berbeda dengan ilmu komputer yang
mengkaji komputasi, komputer dan pemprosesan informasi.
Dalam
komputasi modern menghitung dan mecari solusi dari masalah yang ada, dan
perhitungan yang dilakukan meliputi :
1.
Akurasi
(Big, Floating Point)
2.
Kecepatan
(dalam satuan Hz)
3.
Problem
Volume Besar (Down Sizzing atau Paralel)
4.
Modeling
(NN & GA)
5.
Kompleksitas
(Menggunakan Teori Big O)
Jenis Komputasi Modern
1.
Mobile
computing merupakan kemajuan teknologi komputer sehingga dapat berkomunikasi
menggunakan jaringan tanpa menggunakan kabel dan mudah dibawa atau berpindah
tempat tetapi berbeda dengan komputasi nirkabel.
Contoh
mobile computing :
·
Untuk
pemantauan dan koordinasi, GPS.
·
Peralatan
emergensi atau akses ke dunia luar
·
Akses
web dalam keadaan bergerak
·
Location
aware services
·
Information
services
·
Disconnected
operations (mobile agents)
·
Entertaintment
(Network game groups)
Jenis
mobile computing
§
Laptop
§
Wearable
computer
§
PDA
§
Smartphone
§
Carputer
§
UMPC
2.
Grid
computing menggunakan komputer yang tepisah oleh geografis, didistribusikan dan
terhubung ole jaringan untuk menyelasaikan masalah komputasi skala besar.
Contoh
grid computing :
·
Scientific
Simulation
·
Medical
Images
·
Big
Science
·
E-Learning
·
Visualization
·
Microprocessor
·
Computing-Aided
Drug Discovery
3.
Cloud
computing sebuah teknologi yang menjadikan internet sebagai pusat server untuk
mengelola data dan juga aplikasi pengguna.
Contoh
cloud computing :
·
Email
·
Data
storage online
·
Kolaborasi
·
Virtual
office
·
Kekuatan
ekstra processing
Implementasi komputasi dalam bidang kimia
Kimia
komputasi merupakan salah satu cabang kimia yang menggunakan hasil teori kimia
dan kemudian di terjemahkan ke dalam program komputer. Salah satu implementasi
komputasi dalam bidang kimia adalah Computational chemistry. Yaitu penggunaan
ilmu computer untuk membatu
menyelesaikan masalah kimia. Contohnya penggunaan super komputer untuk
menghitung struktur dan sifat suatu molekul. Istilah kimia komputasi terkadang
digunkan untuk bidang tumpah-tindih antara ilmu komputer dan kimia.
Contoh jurnal kimia menggunakan
komputasi modern
Abstraksi(Anton,
a Special-Purpose Machinefor Molecular Dynamics Simulation)
Kemampuan
untuk melakukan simulasi dinamika molekul dengan panjang dan akurat (MD) yang
melibatkan protein dan makromolekul biologis dan kimiawi lainnya pada dasarnya
dapat memberikan jawaban atas beberapa pertanyaan yang paling penting dalam
bidang biologi, kimia, dan obat-obatan. Berbagai fenomena menarik, namun, dapat
terjadi lebih dari rentang waktu pada urutan dari perintah milidetik (beberapa
dari besarnya melampaui durasi terpanjang saat ini) dalam simulasi MD.
Kami
menggambarkan sebuah mesin massal paralel yang disebut Anton, yang harus mampu
melaksanakan proses dengan skala milidetik dalam simulasi MD klasik sistem
biomolekuler tersebut. Mesin, yang dijadwalkan selesai pada akhir 2008,
didasarkan pada 512 Asics MD-spesifik identik yang berinteraksi secara ketat
ditambah menggunakan jaringan komunikasi khusus berkecepatan tinggi.
Anton
telah dirancang untuk menggunakan kedua algoritma paralel novel dan tujuan
khusus logikauntuk secara dramatis mempercepat perhitungan tersebut yang
mendominasi waktu yang dibutuhkan untuk simulasi MD khas. Pengingat algoritma
simulasi dijalankan oleh diprogram sebuah porsi setiap chip yang mencapai
tingkat substansial paralelisme sambil menjaga fleksibilitas yang diperlukan
untuk mengakomodasi kemajuan diantisipasi dalam model fisik dan metode
simulasi.
Review(Anton, a Special-Purpose
Machinefor Molecular Dynamics Simulation)
Jurnal
tersebut membahas tentang masalah perhitungan dalam Dinamika Molekular dalam
bidang Kimia dan obat-obatan khususnya. Permasalahan tersebut berupa reaksi
kimia molekular yang dapat terjadi dalam waktu yang sangat cepat yaitu dalam
rentang milidetik. Hal tersebut menyebabkan kesukaran bagi manusia dalam
melakukan pengamatan dan penghitungan dengan cara konvensional yaitu dengan
cara manual. Oleh karenanya permasalahan tersebut akan coba diselesaikan dengan
cara mengembangkan sebuah alat komputasi Dinamika Molecular yang mampu
melakukan pengamatan dan penghitungan reaksi kimia dalam skala milidetik.
Metode
perhitungan Anton dalam MD mensimulasikan gerakan kumpulan atom (sistem
kimia)selama periode waktu sesuai dengan hukum Waktu physics. Gaya interatomik
dihitung berdasarkan bidang mekanika molekular kekuatan (atau hanya memaksa
lapangan), yang model gaya pada setiap atom sebagai fungsi dari koordinat
spasial semua atom. Anton menggunakan metode k-ruang Gaussian perpecahan Ewald
untuk mengurangi beban kerja komputasi yang terkait dengan interaksi
elektrostatik. Metode ini membagi perhitungan gaya elektrostatik menjadi dua
komponen. Fase integrasi menggunakan hasil perhitungan gaya untuk memperbarui
posisi dan kecepatan atom, secara numerik mengintegrasikan satu set persamaan
diferensial yang menggambarkan gerakan atom.
Daftar pustaka :
· http://dawn-harmony.blogspot.com/2017/03/implementasi-komputasi-dalam-berbagai.html
· http://generation25al.blogspot.com/2017/03/komputasi-modern-pada-bidang-kimia-dan.html
·
https://ranggaadr.wordpress.com/2018/04/28/komputasi-modern/amp/
Komentar
Posting Komentar